MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623

Total Repeats: 12562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019966	ACC	2	6	330593	330598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_019966	TTG	2	6	334424	334429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_019966	GCA	2	6	334436	334441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_019966	CAG	2	6	334443	334448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_019966	TAA	2	6	334523	334528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_019966	GGGC	2	8	334541	334548	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
507	NC_019966	CTGG	2	8	334940	334947	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
508	NC_019966	CGT	2	6	334991	334996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_019966	GCG	2	6	335727	335732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_019966	CG	3	6	336181	336186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_019966	CGA	2	6	336199	336204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_019966	GCC	2	6	336210	336215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_019966	GGC	2	6	336224	336229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_019966	CGC	2	6	336271	336276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_019966	TTG	2	6	338623	338628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_019966	TC	3	6	338805	338810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_019966	GCT	2	6	338841	338846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_019966	GGA	2	6	340253	340258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_019966	CCG	2	6	340274	340279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_019966	GC	3	6	340297	340302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_019966	CG	3	6	340347	340352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_019966	CGC	2	6	340421	340426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_019966	CG	3	6	340463	340468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_019966	GCT	2	6	340508	340513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_019966	GCT	2	6	340519	340524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_019966	GTA	2	6	340538	340543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_019966	CCAC	2	8	340572	340579	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
528	NC_019966	CGC	2	6	340630	340635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_019966	CGC	2	6	340719	340724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_019966	TCG	2	6	340859	340864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_019966	CCG	2	6	341458	341463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_019966	GCC	2	6	341492	341497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_019966	GCG	2	6	342897	342902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_019966	TCGTTG	2	12	342904	342915	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
535	NC_019966	GCT	2	6	342985	342990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_019966	CGA	2	6	342993	342998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_019966	CTG	2	6	344674	344679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_019966	CTGTC	2	10	346082	346091	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
539	NC_019966	TGC	2	6	346206	346211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_019966	AAT	2	6	346215	346220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_019966	GTT	2	6	346227	346232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_019966	AC	4	8	346271	346278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_019966	GCA	2	6	346410	346415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_019966	GAGG	2	8	346438	346445	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
545	NC_019966	CGA	2	6	346447	346452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_019966	CCT	2	6	353060	353065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_019966	ACT	2	6	353074	353079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_019966	CAA	2	6	353095	353100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_019966	CGAA	2	8	353127	353134	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_019966	CTA	2	6	353139	353144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_019966	GGCAG	2	10	353186	353195	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
552	NC_019966	GA	3	6	353229	353234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_019966	CGA	2	6	354218	354223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_019966	AC	3	6	354280	354285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_019966	CGA	2	6	354319	354324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_019966	CGG	2	6	354327	354332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_019966	CCG	2	6	354351	354356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_019966	CGAA	2	8	354678	354685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
559	NC_019966	GA	3	6	354687	354692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_019966	GTC	2	6	354716	354721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_019966	GGGGA	2	10	354740	354749	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
562	NC_019966	GCC	2	6	356076	356081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_019966	CCA	2	6	357175	357180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_019966	GCGT	2	8	357451	357458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
565	NC_019966	CGTTG	2	10	357510	357519	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
566	NC_019966	AGC	2	6	358355	358360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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568	NC_019966	CGC	2	6	358427	358432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_019966	GCC	2	6	358455	358460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_019966	CAG	2	6	358517	358522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_019966	TCA	2	6	358533	358538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_019966	GCC	2	6	361670	361675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_019966	TGCG	2	8	363758	363765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
574	NC_019966	CGA	2	6	363769	363774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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581	NC_019966	CGA	2	6	365166	365171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_019966	AAT	2	6	365331	365336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_019966	GCGGGC	2	12	390135	390146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_019966	GTC	2	6	390147	390152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_019966	CGC	2	6	390199	390204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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611	NC_019966	GGGTC	2	10	400915	400924	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
612	NC_019966	CGC	2	6	400956	400961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_019966	ATCT	2	8	400964	400971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
614	NC_019966	AGG	2	6	400981	400986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_019966	CGG	3	9	401625	401633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_019966	ACC	2	6	401646	401651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_019966	AGGG	2	8	401702	401709	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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622	NC_019966	CA	3	6	401799	401804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_019966	ACCA	2	8	402877	402884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_019966	CGG	2	6	402923	402928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_019966	GAC	2	6	402941	402946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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627	NC_019966	GTCG	2	8	404840	404847	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
628	NC_019966	CCG	2	6	404881	404886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_019966	CGA	2	6	404909	404914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_019966	CGC	2	6	404917	404922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_019966	GCCG	2	8	404933	404940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_019966	GCC	2	6	404952	404957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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634	NC_019966	GGA	2	6	405008	405013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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